OpenWorm Browser

项目定位

OpenWorm Browser 是一个开源3D可视化工具，专注于展示秀丽隐杆线虫（C. elegans）的完整连接组（Connectome）与神经模拟。它由 OpenWorm 项目团队开发，旨在为神经科学研究者、生物信息学爱好者提供交互式探索平台。

核心功能

技术架构

• 前端渲染：Three.js 构建3D场景，支持鼠标拖拽旋转/缩放
• 数据层：基于 OpenWorm 项目的 NeuroML 格式神经模型
• 交互逻辑：点击神经元触发高亮显示与突触连接轨迹动画
• 跨平台：WebGL 标准，兼容 Chrome/Firefox/Safari 等主流浏览器

使用场景

1. 教学演示：清晰展示线虫神经系统的拓扑结构
2. 神经科学研究：验证连接组数据与行为模拟的关联性
3. 计算神经科学：作为合成神经网络的基准测试平台

操作指南

• 导航：鼠标左键旋转视角，右键平移，滚轮缩放
• 查询：点击任意神经元球体，右侧面板显示其输入/输出突触列表
• 重置：双击空白区域恢复初始视角
• 数据导出：支持将当前视角状态保存为 JSON 格式

局限性说明

• 当前版本仅包含线虫的神经元连接数据，未整合肌肉/感觉细胞模型
• 突触权重为标准化值（0-1），非真实电生理测量数据
• 需 WebGL 2.0 支持，部分老旧设备可能无法流畅运行

延伸阅读

• OpenWorm 项目官网：http://openworm.org
• 原始连接组论文：White JG, Southgate E, Thomson JN, Brenner S (1986). The structure of the nervous system of the nematode Caenorhabditis elegans